ガイナックスによる人気ロボットアニメの劇場版「天元突破グレンラガン/紅蓮篇」に続く第2弾大グレン団は螺旋族王四天王を撃破し王都テッペリンにて螺旋王ロージェノムとの壮絶な一騎打ちを制したシモン王都攻略後瞬く間に文明を構築した人類だったが宇宙にまでその手を伸ばしたとき正体不明の敵が現れる……